看网上教程，最后选择了这种rpc调用的方式，这种方式可以提前启动R虚拟机，R程序造成的崩溃不会影响到java程序。另一种方式是JRI，全名是Java/R Interface
第一步R安装Rserve，这里有点问题就是最好root权限安装，我看文档这种方式需要源码安装，并且有$R_HOME/bin权限。所以直接root启动r然后安装了，install.packages("Rserve")。这里试了一下R INSTALL 好像只能安装本地的包。最后决定安装官网的最新版本，目前还没在CRAN中。install.packages("Rserve",,"http://rforge.net")
第二步启动R server，命令行执行 R CMD Rserve，这个就是上边说的daemon模式，文档说只支持unix系统，windows还不行。默认启动端口6311.看参数好像只能指定端口，不支持指定IP。看文档只能通过配置文件去指定是否允许远程访问。写一行remote enable就行了，我没在默认/etc/Rserv.conf 改，直接参数指定的文件。
第三步java客户端连接，这里需要两个jar包，官方网站能下载，看版本有点老，安装包也带。目录在 /home/xx/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0/Rserve/java/ 包的安装目录下。然后javac -classpath ./REngine.jar:./Rserve.jar:. test.java，测试运行一下没啥问题。数据类型的转换问题还需要详细研究一下。
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